EM微生物制劑在農(nóng)業(yè)上的使用是廣范圍的，不僅在糧食田中的使用是很有效果的，在果園中，在大棚蔬菜種植中，在菌類產(chǎn)品的使用中，都是有很好效果的。
食用菌類產(chǎn)品，如香菇、木耳、牛肝菌等，這些產(chǎn)品在種植中使用EM微生物制劑的稀釋液或者是堆肥，能改善菌料理化性狀，提高產(chǎn)品生長(zhǎng)率和品質(zhì)，而且降低成本，大幅提高收益。在食用菌生產(chǎn)過(guò)程的拌料、發(fā)酵、催菇以及每潮采收后噴灑500倍稀釋液的EM微生物制劑不僅能分解菌料中的殘留農(nóng)藥成分，還能菌類產(chǎn)品中的纖維素、半纖維素、菌體蛋白、多種氨基酸、核酸、維生素和生理活性物質(zhì)，同時(shí)能抑制和消滅食用菌中的雜菌，給食用菌提供豐富的營(yíng)養(yǎng)。使用EM微生物制劑噴灑之后的食用菌個(gè)兒大、質(zhì)量好、重量達(dá)標(biāo)、味道好、韌性好、貯存運(yùn)輸方便，十分具有市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)力。
在果園中使用EM微生物制劑，增產(chǎn)增收益，對(duì)茶葉、桑樹(shù)、人參、中藥材、花卉等“嬌貴”產(chǎn)品，有著十分的裨益。
在果園中的使用方法：（1）在整理果園種植幼苗的時(shí)候，先使用EM微生物制堆肥均撒果園；在育苗過(guò)程中，用200倍稀釋液浸種泡根，之后將稀釋液澆根或者是葉面噴施；（2）采果或者是萌芽的時(shí)候，每畝地用100斤的堆肥作基肥，壯大土壤肥力，供給肥力給果實(shí)；（3）在作物的生長(zhǎng)過(guò)程中，春芽長(zhǎng)至1公分左右后，每周一次的給果樹(shù)噴灑1000倍稀釋液用來(lái)防蟲(chóng)，到果實(shí)即將成熟時(shí)期，每月一次的給果樹(shù)噴灑1000倍稀釋液防治病蟲(chóng)害；（4）在果樹(shù)的現(xiàn)蕾期和花謝末期，各噴灑一次1000倍稀釋液，提高座果率，但是不要在開(kāi)花期使用；（5）果樹(shù)穩(wěn)果期或者是壯果期，各噴灑一次1000倍稀釋液，如果長(zhǎng)勢(shì)好，噴一次就行，如果長(zhǎng)勢(shì)弱一些，就多噴幾次，能提高作物產(chǎn)量和品質(zhì)；（6）在秋季至入冬前，每15天噴灑一次EM微生物制1000倍稀釋液，防止冬季落葉；EM微生物制在水果保鮮中的使用是很有必要的。在采果前，在鮮果周圍噴灑一次1000倍稀釋液，之后晾干裝筐，再用塑料膜覆蓋四周，每隔一周檢查一次，挑出爛果后，用500倍EM微生物制劑稀釋液噴灑一次，再晾干裝筐堆放，四周復(fù)蓋。經(jīng)此法處理的水果，比傳統(tǒng)方法可延長(zhǎng)保鮮時(shí)間1-2倍。
在果園中的使用方法同樣適用在茶園、中藥材、人參、花卉種植上，提高作物產(chǎn)量，作物品質(zhì)，增加收益。